水体污染对人体的危害最为直接，影响人类正常新陈代谢，危害人体健康，杂质过多，长期饮用，使人体产生结石；汞、铜、锌、铅、镉、铬、砷等重金属超标，对人体的伤害极大。常见的有： 
汞：食入后直接沉入肝脏，对大脑、神经、视力破坏极大。
镉：导致高血压，引起心脑血管疾病；破坏骨骼和肝肾。
铅：是中毒性较大的一种，一旦进入人体将很难排除。能直接伤害人的脑细胞，特别是胎儿的神经系统，可造成先天智力低下
钴：能对皮肤有放射性损伤。 
钒：伤人的心、肺，导致异常。 
锑：与砷能使银手饰变成砖红色，对皮肤有放射性损伤。
铊：会伤害人体健康。 
锰：超量时会使人甲状腺机能亢进。也能伤害重要器官。
砷：是砒霜的组分之一，有剧毒，会致人迅速死亡。长期接触少量，会导致慢性中毒。另外还有致癌性。
这些重金属中任何一种都能引起人的头痛、头晕、失眠、健忘、神精错乱、关节疼痛、结石、癌症。尤其对孕妇、母婴、老年人，危害加严重。
 
       1931年首发于日本富山县神通川流域的痛痛病，长期误认为是原因不明的地方病。经10余年的调查研究才证实痛痛病是镉引起的慢性中毒，是神通川上游铅锌矿的选矿废水和废渣污染河水造成的；2005年1 2月1 5号，广东北江的韶关段发现的有毒物质严重超标；水俣病(minamata disease)1953年发生在日本南部沿海的水俣湾，1985年已有患者2000多人。以后，在加拿大、瑞典、伊拉克等也有局部水域受污染而发生甲基汞中毒的报道。